I percorsi di secondo livello sono finalizzati al conseguimento del diploma di istruzione tecnica, professionale e artistica e sono erogati presso gli Istituti Superiori presso i quali restano incardinati i corsi serali per il conseguimento dei diplomi di scuola secondaria superiore. Il CPIA 2 Varese ha stipulato un accordo di rete con i seguenti Istituti di scuola secondaria di secondo grado per i corrispondenti corsi serali:

Istituto- sede Indirizzo
IISS “Newton” di Varese Istituto Tecnico: Informatica
Istituto Tecnico: Meccanica e Meccatronica
Istituto Professionale: Manutenzione ed assistenza tecnica (MAS)
IT “Daverio-Casula-Nervi” di Varese Amministrazione, Finanza e Marketing (AFM)
Amministrazione, Finanza e Marketing – sistemi informativi aziendali
Costruzioni, ambiente e territorio (CAT)
IPSSCTS “Einaudi” di Varese Servizi per la sanità e l’assistenza sociale
Liceo Artistico “A. Frattini” Varese
Arti figurative 
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